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氨基酸广义疏水标度(GH-scale)用于HLA-A*0201限制性CTL表位的定量预测研究
氨基酸广义疏水标度 HLA-A*0201 CTL表位 定量构效关系 遗传-偏最小二乘回归
2013/10/21
天然氨基酸149个疏水性质经主成分分析得到了一种新氨基酸描述子——氨基酸广义疏水标度(GH-scale). 用GH-scale结合遗传偏最小二乘(GPLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行定量构效关系(QSAR)研究. 所建模型拟合及交叉检验复相关系数分别为<=0.813sPA CLASS="formnla">和Q2 = 0.725. 研究表明, 疏水作用在CTL表位与HLA...