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现生哺乳动物牙齿多样性极高,但它们都源自一种叫做磨楔齿的牙齿模式(tribosphenic pattern),这个概念由G.G. Simpson, 1936年提出。磨楔齿的上臼齿舌侧发育原尖,下臼齿具三角座和后端的盆形跟座。在咬合过程中,上原尖咬在下跟座里,上下齿尖、齿脊间既有剪切,又有挤压研磨功能,是哺乳动物特有的高效处理消化食物的方式。1982年,中国科学院古脊椎动物与古人类研究所周明镇院士和...
现代长江的起源及南亚、东亚水系的演变与新近纪青藏高原隆升和现代亚洲季风系统建立息息相关。然而，准确刻画长江水系的时空演变规律一直以来都面临挑战。之前的地质学研究基于不同的采样地点、测年方法和替代指标进行了估算，认为古金沙江在“第一湾”开始改道东流和三峡贯穿的时间从始新世到最近的更新世都有可能。
中国科学院古脊椎所重建无角犀类的系统发育关系（图）
古脊椎所 无角犀 动物演化
2023/3/14
2023年3月9日，中国科学院古脊椎动物与古人类研究所邓涛研究团队在Frontiers in Ecology and Evolution上在线发表了论文，系统梳理了犀牛诸多特征的演化趋势，厘清了无角犀亚科内部分类群的系统发育关系及其与真犀科其他类群的系统关系，提出了新的观点，为进一步准确而细致的系统分类工作奠定了基础。
近日，中国科学院昆明动物研究所蒋学龙课题组与安徽师范大学等合作单位在缺齿鼩属系统发育和分类研究中取得新进展，研究成果以Integrative systematic analyses of the genus Chodsigoa (Mammalia: Eulipotyphla: Soricidae), with descriptions of new species为题，发表在动物学专业期刊Zool...
白腹鼠是一类分布于东南亚和中国大部地区的啮齿类动物，受限于其形态的相似性和模式标本保存地的分散性，白腹鼠属物种归属和界定与系统学一直存在诸多争议。
为解决白腹鼠属系统发育关系、厘定其分类系统、评估其物种多样性，蒋学龙课题组通过大量文献回溯，通过在中国广泛采样（白腹鼠属各物种、亚种和同物异名的地模标本）及收集邻近地区的样品，使用分子系统学方法对标本和样品进行比较分析。
中国科学院昆明动物研究所在鼩鼹亚科系统发育研究中取得新进展（图）
鼩鼹 亚科系统发育 物种分化时间
2013/11/6
现生鼩鼹（shrew-like moles）栖息在中国西南的横断山系及周边地区，是鼹科中最原始的一支。由于形态上的保守性和野外采样的难度，有关该类群生物系统学的研究仍十分有限。另外，现生鼩鼹的分布区是全球最重要的生物多样性热点地区之一。中新世以来的全球气候变化和频繁的地质运动造就了这一区域复杂的地理景观，极大塑造了特有类群的遗传格局。然而，该地区生物多样性的发生机制仍存在一定争议。因此，通过分子系...
草兔线粒体基因组全序列及其系统发育关系分析
线粒体基因组 系统发育分析 草兔
2016/7/19
草兔(Lepus capensis)在我国数量多,分布广,但人们对草兔的系统地理学、草兔与其他兔类的系统发育关系了解不多,其亚种水平的分类也长期存在争议。本研究通过LA-PCR 技术对草兔线粒体基因组全序列进行PCR 扩增、序列测定和分析,并基于线粒体基因组12 个蛋白质编码基因10 776 bp的核苷酸序列,采用贝叶斯法(BI)和最大似然法(ML)构建哺乳纲(Mammalia) 灵长总目(Eua...
基于13个内含子的序列探讨鲸目的系统发育关系
鲸目 内含子 系统发育分析 松散分子钟
2016/7/20
本文基于实验室筛选得到的13 对内含子标记,在鲸偶蹄目的15 个物种中进行有效扩增,并重建了这15个物种的系统发育关系。结果表明,抹香鲸总科(Physeteroidea) 位于齿鲸亚目(Odontoceti)的基部,从而支持了传统的齿鲸亚目的单系性。在海豚总科(Delphinoidea)内部,贝斯分析结果支持了鼠海豚科(Phocoenidae)和一角鲸科(Monodontidae)的姐妹群关系,而...
哺乳动物系统发育基因组学研究进展
系统发育基因组学 哺乳动物 系统发育树 染色体涂染
2016/7/20
哺乳动物是一类最进化并在地球上占主导地位的动物类群,重建其系统发育关系一直是分子系统学的研究热点。随着越来越多物种全基因组测序的完成,在基因组水平上探讨该类动物的系统发育关系与进化成为研究的热点。本文从全基因组序列,稀有基因组变异及染色体涂染等几个方面简要介绍了当前系统发育基因组学在现生哺乳动物分子系统学中的应用,综合已有的研究归纳整理了胎盘亚纲的总目及目间的系统发育关系,给出了胎盘动物19 个目...
动物系统发育和大规模测序：进展和问题
long-branch attraction (LBA) artifact new animal phylogeny phylogenomics random error systematic error
2009/8/4
Phylogenomics, the inference of phylogenetic trees using genome-scale data, is becoming the rule for resolving difficult parts of the tree of life. Its promise resides in the large amount of informati...
蝗科高级阶元的分子系统发育(英文）
系统发育 蝗科 16S rDNA 12S rDNA
2009/6/23
迄今，蝗科内各分类阶元之间的系统发生关系大部分是未知的。本文用12S rDNA和16S rDNA两个基因的联合序列(795 bp)数据，以锥头蝗科的锥头蝗为外群，重建了分子系统树。研究结果表明，在12S rDNA与16S rDNA组成的联合数据中，转换的替代速率明显比颠换的替代速率高得多，核酸的替代已经发生了饱和。分子系统树表明：斑翅蝗亚科是一单系群，该亚科是一个合法的亚科，但斑腿蝗亚科和蝗亚科都...
中国铃蟾属的分类和系统发育
铃蟾属 系统发育 分类 中国
2009/6/19
铃蟾属Bombina分布地跨欧亚二洲. 近数十年来,国外学者对这类原始无尾类的分类和进化进行过不少研究,但亚洲产种类的种间亲缘关系仍不清楚,有些种在分类上尚存在疑问.本文以形态为基础,辅以核型资料,试图对中国铃蟾属的分类和进化问题进行探讨. 研究结果发现: 中国南部产3种(亚种)之间的亲缘关系较近,是一个祖先的后裔.其中强婚刺铃蟾属B.fortinuptialis 和微蹼铃蟾B.microdela...
双壳纲动物核糖体RNA 18S-ITS1序列及其在分子系统发育研究中的应用18S-ITS1 Sequence of rRNA in Bivalves and its Application in Phylogenetic Analysis
ITS1 18S RNA 遗传多样性 双壳纲
2008/1/20
摘要
测定了双壳纲不同科、属、种及种内共11个个体的核糖体RNA 18S-ITS1序列。结果表明，该序列在种间存在很高的多态性，长度从558 bp到784 bp不等，碱基差异百分比在10.7%~61.7%之间， ITS1序列同源性很低，有片段的插入与缺失。种间18S部分序列碱基差异百分比在0.9%~23.7%之间，变化主要是碱基的转换。用邻接法（NJ）构建了8个种的18S部分序列（约240 bp...