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中国林业科学研究院亚林所发布第一个自主知识产权的国外松液相基因芯片(图)
基因 遗传 分析 群体
2024/10/20
湿地松、火炬松是我国南方重要的人工林树种,其基因组大小超过20G,是杨树基因组的50多倍,从而成为植物分子育种中最难啃的“硬骨头”类型。中国林科院亚林所林木种质资源研究团队2024年来瞄准国际针叶树育种前沿,开发湿地松\火炬松基因组和表型组技术,在巨大基因组基因分型和长周期大乔木高通量表型获取方面取得良好进展,并成功将二者结合用于基因挖掘和遗传分析,其成果2024年6月13日以两篇独立的研究文章发...
双色荧光杂交芯片在近交系小鼠遗传监测中的应用
SNP 双色荧光杂交 小鼠
2009/6/22
应用一种新的高通量SNP检测方法-双色荧光杂交芯片技术进行近交系小鼠遗传监测。应用双色荧光杂交芯片技术对4个品系近交系小鼠的多个基因组DNA 样本进行SNP分型,整合6个SNP位点的芯片杂交信息,对样本所属品系进行判断。研究结果表明SNP检测方法-双色荧光杂交芯片技术能够对选定的6个SNP位点进行高准确率分型;双色荧光杂交芯片技术是一种高通量SNP检测的良好工具,适合于对少量近交系品系来源的大样本...
应用cDNA芯片分析79个新基因的人胚组织表达谱
cDNA芯片 新基因 表达序列标签(EST) 差异表达RNA分析
2008/6/12
大规模cDNA测序和生物信息学技术相结合,得到来自于商品化的人胚肾cDNA文库79个代表新基因的表达序列标签(EST).随后,采用高速度机械手制备这些cDNA的基因芯片,用于鉴定79个新基因的ESTs在20周、26周两个胚胎时期6种组织中的基因表达状况,以研究这些EST片段代表的新基因功能提供线索.通过芯片杂交及结果分析,得到同一个组织两个不同时相8个差异表达的基因,随后的RNA印迹分析的...
摘要
提出了一种新的DNA芯片的封闭方法:1-碘丙烷封闭方法,并对1-碘丙烷和琥珀酸酐两种不同的封闭方法的封闭效果进行了比较实验,研究封闭试剂、封闭时间对氨基DNA芯片杂交结果所产生的影响。结果表明: 1-碘丙烷封闭效果明显好于琥珀酸酐的封闭效果,用1-碘丙烷封闭后的芯片进行杂交,芯片杂交信号强、背景噪声低,灵敏度高,整个封闭过程实验操作简单,时间短,1h即可达到所需效果。1-碘丙烷可以作为一种...
Tropic1808基因作用于PC12细胞的表达谱芯片分析
tropic1808 基因芯片 表达谱 PC12细胞
2007/12/20
摘要 为探讨tropic1808基因作用的分子机制,采用高密度寡核苷酸芯片(Affymetrix芯片)对表达tropic1808基因和空载体的PC12细胞株进行转录水平分析.基于获得的基因表达信息,对UCSC、TRANSFAC、NCBI等公共数据库进行检索,观察表达tropic1808基因导致PC12细胞株的基因表达谱变化.在检测的15866个目标基因中,855个基因表达上调,80个有显著比较意义...
摘要 以氯高铁血红素 (hemin)诱导K5 6 2分化作为体外红细胞分化模型 ,结合cDNA大规模测序、生物信息学分析、基因芯片杂交和NorthernBlot分析等技术 ,筛选红细胞分化相关的新基因 .首先利用大规模测序技术从人胚肾cDNA文库中随机挑选克隆测得 192个EST(expressedsequencetags)片段 ,经在线生物信息学分析 ,得到 79个代表新基因的未知EST片段 ,...