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对杂交三倍体泥鳅（4n♀×2n♂）的胚胎染色体进行了C带及染色体荧光原位杂交（FISH）分析，首次探讨了杂交三倍体泥鳅C带特征，为准确鉴别染色体提供依据，研究了核糖体5.8S+28S rDNA在杂交三倍体泥鳅胚胎中期染色体上的数目和位置。C带结果表明，杂交三倍体泥鳅的染色体C带包括臂端C带和着丝粒C带，没有发现臂间C带。M染色体只有1号染色体既有臂端C带又有着丝粒C带，但臂端C带均比着丝粒C带大，...
基于16S rDNA序列的小贯小绿叶蝉共生细菌多样性研究
小贯小绿叶蝉 细菌 16S rDNA 多样性
2018/6/26
利用Illumina HiSeq技术, 对赤壁、大悟、武汉、咸安和英山5个茶园小贯小绿叶蝉地理种群的成虫共生细菌16S rDNA-V4变异区进行测序, 应用Uparse和RDP Classifier等软件统计和分析样本的物种组成、丰度和多样性。5个地区小贯小绿叶蝉成虫的16S rDNA基因序列文库共获得239 645条有效tags, 在97%相似阈值下将其聚类为3 403个OTUs。共注释到41个...
黄蒿丛枝病植原体的鉴定及其16S rDNA序列分析
黄蒿丛枝病 葡萄黄化植原体 分子鉴定 16S rDNA序列分析
2018/12/29
黄蒿为菊科蒿属一、二年生草本植物, 在医学和植物病害生物防治方面具有重要价值。植原体是一类重要的病原物, 常引起丛枝、小叶、黄化、簇生等症状。从山东泰山山涧采集到表现丛枝症状的感病黄蒿植株, 以叶片总DNA为模板, 利用植原体通用引物对R16F2n/R2进行PCR扩增, 获得了大小为1 244 bp的片段, 与葡萄黄化(Stolbur)植原体(AF248959)和纸花黄化植原体(JX128698)...
利用16S rDNA基因及线粒体DNA细胞色素氧化酶亚基Ⅰ（cytochrome oxidase subunit I gene，COⅠ）基因建立3种形态学特征相近的血蜱属蜱类-长角血蜱、褐黄血蜱及铃头血蜱的分子生物学鉴定方法，探讨它们的系统发生关系。 方法 在上海市动物体表采集寄生蜱，在解剖显微镜下进行形态学鉴定后，提取蜱样本基因组DNA，采用PCR方法从蜱基因组中扩增16S rDNA及COⅠ基因...
Characterization of yeast U14 snoRNA interactions required for rRNA processing, and development of a novel in vivo rDNA system for dissecting ribosome biogenesis
U14 small nucleoli ribosomal RNA DNA bases yeast elements
2014/12/11
U14 small nucleolar RNA (snoRNA) is required for processing of 18S ribosomal RNA. It was hypothesized that U14 might base pair with 18S RNA through two highly conserved U14 sequence elements known as ...
三种稻飞虱体内类酵母共生菌18S rDNA和 ITS5.8S rDNA序列克隆及进化分析
稻飞虱 灰飞虱 褐飞虱 白背飞虱 酵母类共生菌 18S rDNA ITS-5.8S rDNA 系统发育分析
2013/9/14
为研究水稻3种主要害虫灰飞虱Laodelphax striatellus、 褐飞虱Nilaparvata lugens和白背飞虱Sogatella furcifera体内类酵母共生菌（yeast-like symbiotes, YLS）的种属地位及与寄主的进化关系， 测定了其体内YLS的18S rDNA及ITS-5.8S rDNA的全长序列。基于3种稻飞虱体内YLS的18S rDNA序列比对表明，...
Wolbachia是一类胞质遗传的内共生菌, 广泛分布于节肢动物和其他动物中, 与宿主的生殖调控密切相关。通过研究迁飞性害虫稻纵卷叶螟Cnaphalocrocis medinalis (Guenée)的Wolbachia感染情况, 为探讨Wolbachia在迁飞性昆虫中的生殖调控和传递方式等提供基础资料。本研究应用Wolbachia的ftsZ基因和16S rDNA基因的特异性引物, 通过PCR扩增...
rDNA-ITS序列鉴定深部真菌菌种的研究进展
ITS区 鉴定 深部真菌
2012/8/9
目前深部真菌病的发生率呈逐渐上升趋势,有关深部真菌菌种的鉴定成为研究热点。由于传统的菌种鉴定方法存在费时及易受实验条件影响等不足,核糖体rDNA-ITS序列分析法已越来越广泛的应用于真菌属内不同种间的系统发育研究中。本文综述了核糖体rDNA-ITS鉴定深部真菌菌种的研究进展,展望了其应用前景。
金黄壳囊孢菌 rDNA ITS序列测定及生理学特性
金黄壳囊孢菌 培养特性 rDNA ITS序列 物候期
2011/8/17
通过在实验室内培养杨树烂皮病菌金黄壳囊孢菌菌株CC1,确定了其孢子萌发有一定的物候期,产孢规律与自然条件下杨树烂皮病的发病季节一致,其菌丝生长不随季节的变化而变化。菌株CC1的生长最适温度30℃,最适pH值为5～6,最适碳氮源分别是葡萄糖和蛋白胨。最适培养基配方:马铃薯200 g,蔗糖20 g,酵母膏2 g,蛋白胨2 g,硫酸镁0.5 g,磷酸二 氢钾1.5 g,维生素B1 100 mg,琼...
昆虫消化道内是一个复杂的微生态系统， 有大量的微生物存在。这些微生物对寄主发育、 营养吸收和防御方面都起着重要的作用。本文利用基于16S rRNA基因的PCR-RFLP指纹图谱法和变性梯度凝胶电泳（denaturing gradient gel electrophoresis, DGGE）的方法对柑桔黄龙病虫-媒柑桔木虱Diaphorina citri体内细菌菌群多样性进行了研究。经PCR-RFL...
16S rDNA同源性所揭示的双歧杆菌与有关细菌的亲缘关系
双歧杆菌 16S rDNA同源性 系统发育
2009/9/10
本研究测定了低GC含量的双歧杆菌(Bifidobacterium inopinatum)和新种B.thermacidophilum的16SrDNA全序列，在同另外19个双歧杆菌及 8个相关细菌的16SrDNA同源性分析的基础上构建了系统发育树。结果表明：除低GC含量的B.inopinatum外，所有双歧杆菌的种在16S rDNA序列相似性≥92%的水平上聚类为一个簇群。尽管B.inopinatu...
基于两个叶绿体基因(matK和rbcL)和一个核糖体基因(18S rDNA)的序列分析, 对代表了基部被子植物和单子叶植物主要谱系分支的86科126属151种被子植物(单子叶植物58科86属101种)进行了系统演化关系分析。研究结果表明由胡椒目Piperales、樟目Laurales、木兰目Magnoliales和林仙目Canellales构成的真木兰类复合群是单子叶植物的姐妹群。单子叶植物的单系...
基于18S rDNA序列的蝽次目(半翅目：异翅亚目)
分子系统发育 蝽次目 18S rDNA 毛点类
2009/6/23
利用18S rDNA分子约1 912 bp的序列对蝽次目21个科53个种进行系统发育分析。运用MP法、ML法和NJ法分析后的结果表明：蝽次目的单系性得到很高的支持；扁蝽总科成为毛点类的姐妹群；毛点类基本确定为两大分支：一支包含蝽总科和红蝽总科；另一支主要由长蝽总科、缘蝽总科和南蝽总科组成；长蝽总科和缘蝽总科都是多系；长蝽总科中，跷蝽科和皮蝽科的关系最近，构成姐妹群，位于整个毛点类的基部；与长蝽总科...
基于28S rDNA序列的鞘藻目系统发育研究
鞘藻目 细胞核编码的核糖体大亚基 系统发育 Bayesian方法
2009/6/3
作者进行了较广泛的样品采集，通过实验分离纯化培养得到多个鞘藻目种类的株系，并采用PCR技术新获得
鞘藻目2属8个种类的部分28S rDNA序列，连同GenBank中的另两条序列，分析的物种涵盖了鞘藻目中的每个属。
通过比较分析绿藻纲中包括此1O条序列的共36个种类的同一基因序列，并选取Trebouxiophyeeae中的椭圆小球藻
(Chlorella ellipsoiden)和 0c pe...