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利用DNA微珠控制培养组织发育—— 分子工程新技术造出复杂类器官
分子工程 DNA 分子生物学
2024/9/11
德国“3D物质定制”卓越集群、马克斯普朗克医学研究所、海德堡大学有机体研究中心和分子生物学中心合作，开发出一种新的分子工程技术。研究团队利用特定折叠的DNA制成的微珠，在组织结构内释放生长因子或其他信号分子，从而精确影响类器官的发育。利用这一技术可培育出更复杂的类器官，更好地模仿人体组织，呈现更真实的细胞组合。研究成果发表在最新一期《自然纳米技术》杂志上。
DNA右手双螺旋结构的提出开启了分子生物学新篇章1。事实上，除右手双螺旋结构外，还存在其他非经典DNA构象，如三链体DNA（triplex DNA）。三链体DNA是由单链DNA通过胡斯坦氢键（Hoogsteen hydrogen bonds）与双链DNA的大沟特异性结合形成的一种三链结构2。该结构在基因组中广泛分布，发挥重要的基因调控作用，并可导致基因组不稳定性。基于以上功能，三链体形成寡核苷酸（...
中国细胞生物学学会副理事长朱冰研究组揭示小鼠母源蛋白Pramel15促进合子DNA去甲基化机制（图）
细胞生物学 朱冰 母源 蛋白 DNA 甲基化 胚胎发育 Nature Communications
2024/8/30
中国科学院生物物理研究所、中国细胞生物学学会副理事长朱冰研究组于2024年8月25日在《Nature Communications》期刊在线发表了题为"Pramel15 facilitates zygotic nuclear DNMT1 degradation and DNA demethylation"的研究工作。该研究发现小鼠母源蛋白Pramel15能够通过降解受精卵细胞核中的DNMT1，控制...
中国科学院动物所等开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术（图）
动物 基因 检测
2024/7/18
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中，PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而，PacBio标准建库方法需要大量DNA输入，限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量，但会引入扩增偏好和人工嵌合序列等错误，影响基因组的完整性以及变异检测的准确性。因此，亟待开发低DNA用量、...
基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。随着价格的下降，基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究(Nat Methods 2022;Nat Rev Gene 2024)；其中，PacBio高保真（High-fidelity,HiFi）测序技术因其高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而，其标准建库方法需要大量DNA输入（>1 μg），限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用(Pro...
2024年7月4日，国际学术期刊Nature Methods在线发表了中国科学院分子细胞科学卓越创新中心（生物化学与细胞生物学研究所）陈玲玲研究组关于CRISPR-dCas12a应用于DNA活细胞标记的最新研究进展：“CRISPR array-mediated imaging of non-repetitive and multiplex genomic loci in living cells”...
中国科学院昆明动物研究所专利：一种抗菌肽和线粒体DNA复合物及其多克隆抗体和应用。
2024年6月27日，微生物技术国家重点实验室主任、德国国家工程院院士、欧洲科学院院士张友明受邀做客鳌山讲坛，作题为“DNA重组工程技术的创新及应用”的专题报告。青岛校区党工委副书记宋作标主持报告会。
天津工业生物所在细菌DNA多拷贝串联重复技术方面取得新进展（图）
细菌 代谢工程 基因
2024/6/18
细菌中构建DNA多拷贝串联重复用途十分广泛，在基因表达、代谢工程及基因组进化等研究中发挥重要作用。现有的DNA多拷贝串联重复技术分为体外和体内构建两种，体外构建通常存在耗时长、限制酶选择难、多聚体不稳定等问题，体内构建相对高效，但常用技术需事先在重复单元两端加上长同源臂，并依赖宿主自身的同源重组系统实现串联重复，且事后需破坏该内源重组系统来维持既得拷贝数的稳定性，对宿主产生潜在不利影响的同时操作依...
提速2倍！DNA比对新算法研发成功（图）
DNA比对 新算法 研发成功
2024/8/23
近日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所农业基因组学技术研发与应用创新团队提出DNA比对新算法，并研发出DNA比对软件“BSAlign”。相比同类并行算法，新算法能够更快生成最优比对结果，且准确度更高。相关研究成果发表在《基因组蛋白质组与生物信息学报（Genomics, Proteomics & Bioinformatics）》上。
国家自然科学基金委员会中国学者在DNA转座子多样性研究和基因工程技术开发方面取得进展（图）
基因工程 细胞 遗传 元件
2024/8/25
在国家自然科学基金项目（批准号：32325014）等资助下，中国科学院动物研究所张勇课题组与王皓毅课题组开展合作研究，在DNA转座子多样性研究和基因工程技术开发方面取得进展。研究成果以“人源细胞130个DNA转座子的异源性调查揭示其功能多样性并扩展基因工程技术工具箱（Heterologous survey of 130 DNA transposons in human cells highligh...
非洲猪瘟病毒DNA拓扑异构酶催化机制研究获新进展
非洲 猪瘟病毒 DNA
2024/8/26
中国科学院生物物理研究所饶子和院士研究组首次阐明非洲猪瘟病毒编码的全长II型DNA拓扑异构酶的基本机制，为减轻非洲猪瘟病毒的影响提供了潜在的干预策略。相关论文于5月30日发表在《自然-通讯》。
自1948年Barbara McClintock首次报道转座子以来1，这类跳跃遗传元件对宿主演化的重要意义逐渐被揭示2-5。其中，DNA转座子作为主要类型之一，长期以来备受关注。然而，由于以往多为个案研究，DNA转座子活性的决定因素与进化模式的一般规律尚不清晰。不仅如此，尽管DNA转座子可作为基因工程工具用于插入诱变或转基因载体6,7，但目前只有Sleeping Beauty（SB）等少数几种转座...
本发明涉及分子生物学技术领域，具体的说就是一种从广泛物种和土壤中提取基因组DNA的方法。现有的基因组DNA提取方法只适用于一个或几个物种，并且从土壤等特殊材料中提取DNA难以去除腐殖质﹑色素等污染物，影响基因组DNA质量。本发明设计的二氧化硅颗粒机械研磨和琼脂糖凝胶电泳相结合的DNA提取方法同时适用于从动物细胞﹑植物植物﹑微生物﹑土壤等广泛的材料中提取基因组DNA。该方法提取的基因组DNA质量高，...
中国水产科学研究院珠江所对鱼类DNA 条形码数据库的开发取得进展（图）
数据 基因 种质资源
2024/6/8
2024年6月5日，珠江水产研究所观赏渔业研究室在国际学术期刊《Database》（JCR 1区，IF2022=5.8）在线发表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究论文。该研究得到了中国-东盟海洋合作基金（CAMC-2018F）、2022年省级乡村振兴战略专项种业...