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SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂的理论研究
SARS冠状病毒3CL蛋白酶 抑制剂 对接 分子动力学模拟
2010/1/19
应用AutoDock程序将SARS冠状病毒3CL蛋白酶及其抑制剂配体和受体进行了对接,并用InsightⅡ中的Discover 3模块进行了分子动力学模拟,分析了蛋白酶活性口袋的形状,讨论了其亚基的氢键、静电、疏水等相互作用,为进一步设计药物提供了重要的参考信息.
采用分子动力学模拟方法, 在分子水平上探讨六钼酸盐有机杂化衍生物潜在的抗SARS病毒活性. 3CLpro主蛋白酶是冠状病毒复制和转录过程中起关键作用的功能蛋白, 因此采用SARS-CoV 3CLpro作为靶标进行抗SARS病毒的药物设计. 使用Insight II软件包中的Biopolymer, Discover 3, Profile-3D和Affinity等模块, 研究 POMs/3CLpro相...
以邻氨基苯甲酸(Abz)为荧光发射基团、2, 4-二硝基苯基乙二胺(Eddnp)为荧光猝灭基团, 设计合成了SARS-CoⅤ 3CL蛋白酶的新型荧光多肽底物: H2N-E(Eddnp)STLQSGLK(Abz)-CONH2. 用液相色谱-质谱(LC-MS)联用技术进行了表征, 表明该多肽底物能被SARS-CoⅤ 3CL蛋白酶识别, 并在QS之间被专一性酶解. 另外, 利用该多肽底物的荧光共振能量...