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通过分子对接建立了一系列含二氟甲基磷酸基团(DFMP)或二氟甲基硫酸基团(DFMS)的抑制剂与酪氨酸蛋白磷酸酯酶1B(PTP1B)的相互作用模式, 并通过1 ns的分子动力学模拟和molecular mechanics/generalized Born surface area (MM/GBSA)方法计算了其结合自由能. 计算获得的结合自由能排序和抑制剂与靶酶间结合能力排序一致; 通过基于主方程的...
摘要 采用同源建模法对α1A-, α1B-和α1D-AR的三维结构进行了模拟, 并采用分子力学、分子动力学方法对所得同源模型进行优化, 然后分别采用训练集拮抗剂对接的方法得到拮抗状态下的α1A-, α1B-和α1D-AR三维结构模型. 得到的模型再采用FRED对接软件对测试集中的18个化合物进行对接并打分, 再将所得打分结果与其活性进行线性回归, 其回归结果具有良好的拟合效果, 由此回归方程预测的...
用放电LIF实验装置,对CCl4/Ar混合气体放电产生CCl2自由基,再用541.52 nm激光将电子基态CCl2激励到激发态A 1B1(0,4,0)振动能级上,通过检测激发态CCl2时间分辨荧光信号,测得室温下CCl2(A 1B1)被烷烃类分子猝灭的实验结果,用我们提出的三能级模型分析处理实验数据,获得CCl2(A 1B1)态和CCl2(a 3B1)态的碰撞猝灭速率常数kA和ka值.

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