搜索结果: 16-29 共查到“知识库 分子生物物理学”相关记录29条 . 查询时间(2.379 秒)
分子发动机是利用化学能/化学势进行机械作功的生物大分子,包括线性分子发动机与旋转式分子发动机两大类.它们参与了胞质运输、DNA复制、基因转录、ATP合成/水解等一系列重要生命活动过程.目前对于各种分子发动机的结构及作用机制的研究取得了一些重要进展.
各种生物的基因组DNA测序计划的完成,将结构生物学带入了结构基因组学时代.结构基因组学是对所有基因组产物结构的系统性测定,它运用高通量的选择、表达、纯化以及结构测定和计算分析手段,为基因组的每个蛋白质产物提供实验测定的结构或较好的理论模型,这将加速生命科学各个领域的研究.生物信息学、基因工程、结构测定技术等的发展为结构基因组学研究提供了保证.近年来核磁共振在技术方法上的进展,使其成为结构基因组学高...
随机十肽库的构建及血管形成素结合肽的筛选
噬菌体表面呈现 随机短肽库 血管形成素
2008/6/29
将合成的含有随机序列(NNK)10的寡核苷酸片段,克隆入噬菌体呈现载体噬菌粒pCANTAB5E的SfiⅠ,NotⅠ位点,即cpⅢ蛋白信号肽与成熟肽之间,电转化E.coli TG1,构建了噬菌体表面呈现的十肽库,实际库容为3.53×107,插入率为66.7%.经辅助噬菌体M13KO7超感染后,获得滴度为4.8 ×1011 pfu/ml的噬菌体上清.经过两轮panning筛选和富集,从构建的随...
分子对接与全局极小化方法
分子对接 全局极小化 势能平滑
2008/5/30
全局极小化方法及其在结构生物学中的应用近年来取得了显著的进展.适当简化的分子对接问题是全局极小化方法的一个很好目标,并且是当前一个相当活跃的研究领域.对接可分为两类:主要用于从头配体设计的细致对接和用于已知化合物数据库筛选以发现药物的粗略对接,它们对全局极小化算法的要求是不同的.简要评述了新出现的适合于对接问题的随机和确定性全局极小化算法,其中势能平滑算法看来很有希望,值得密切关注.
酵母、大肠杆菌和枯草杆菌基因组中短ORF的分布与形成原因
酵母(Yeast) 大肠杆菌(Escherichia coli) 枯草杆菌(Bacillus subtilis) 组分约束下的随机序列(Component-constrained random DNA sequences) 开阅读框架分布(Open reading frame distribution)
2008/5/21
用终止密码方法计算了酵母、大肠杆菌和枯草杆菌基因组中所有的第一类开阅读框架(记为理论ORF),给出了理论ORF和已知ORF随长度的分布,发现长度大于150个氨基酸后,理论ORF与已知ORF 分布基本趋于一致,小于150个氨基酸的理论ORF数目的对数随长度线性变化,并提出这些短ORF 是随机产生的猜想;研究了组分约束下的随机DNA序列中ORF数目、ORF的长度与随机序列总长度和GC含量之间的关系,证...
嵌合体纤溶酶的研究进展
嵌合体(chimeric protein) 纤溶酶(fibrinolytic enzymes) 抗凝血酶活性(antithrombin activity) 抗血小板聚集活性(antipletelet aggregation activity) 纤维蛋白特异性(specially recognizing fibrin sequences) 溶栓(thrombusis) 酶原型嵌合体(pro-protease chimeric)
2008/5/19
嵌合体纤溶酶是采用基因重组技术或化学偶联的方法将纤溶酶与其它的功能多肽(含有酶原结构域,有抗凝血酶、抗血小板聚集活性,能特异识别纤维蛋白的多肽)结合起来所形成的嵌合体蛋白质。它尽可能地保留了分子中每一组分的生物活性,增强了纤溶酶的溶栓功效,较大程度地克服了临床溶栓药物在某些方面的不足,是目前溶栓药物研究领域中的热点。
三维电子显微镜方法进展
三维电镜方法(Three dimensional electron microscopy) 断层成像(Tomography) 单粒子法(Single particle technique)
2008/5/19
从生物样品(细胞或大分子)的电镜图象重组其三维结构的方法近年取得了重大进展,这是冷冻电镜样品制备技术、电镜设备、图象处理和分析方法等几方面进步的综合结果。三维电镜方法的进步和完善,使细胞生物学家得以了解在复杂的细胞过程中各种相关细胞器之间的空间关系,而使分子生物学家不仅可以研究那些能够形成二维结晶的样品,并为分析具有重要生物功能但不能形成二维结晶的大分子或分子聚集物的结构提供了一种强大的手段。
四种结构类型的蛋白质设计方法
设计方法 蛋白质
2008/5/16
给出了以疏水-亲水模型为基础的蛋白质设计方法,该方法以物理学原理为基础,以相对熵作为优化的目标函数。对四种不同结构类型的天然结构的真实蛋白质进行了检测,分析了影响检测成功率的主要因素,结果表明,该方法是普适的,可用于对不同结构类型的蛋白质设计序列。
分子运动性预测麻栎种子离体胚轴适宜贮藏条件初探
顽拗性种子(recalcitrant seeds) 离体胚轴(excised axes) EPR 分子运动性(molecular mobility) 贮藏(storage)
2008/3/6
应用电子顺磁共振波谱仪和自旋标记技术,以硝基氧探针为标记物,检测了室温下麻栎种子离体胚轴脱水过程中分子运动性的变化。发现含水量0.7 g H2O/g DW至0.64 g H2O/g DW范围是细胞质粘度的转折区域,低于这个含水量区域,细胞质粘度骤然上升,推测这个区域是室温下保存离体胚轴的适宜含水量下限。通过变温电子顺磁共振波谱测定,找到离体胚轴含水量在0.43 g H2O/g DW至1.0...
分子马达定向运动的两态模型
定向运动 有效势 细致平衡
2008/3/6
采用非对称周期势来描述马达蛋白与具有周期性和极性的微丝轨道之间的相互作用,计算了马达蛋白两态模型的几率流和有效势之间的关系。计算结果表明:马达蛋白的定向运动不仅与有效势的整体倾斜密切相关,还与有效势的势垒高度有关。有效势倾斜等效于一个平均力的作用,而这一平均力的存在体现了两态跃迁细致平衡的破坏。同时将不同ATP浓度下力与速度的关系曲线与实验作了比较,这些曲线与实验定性吻合。TWO-STAT...
分子对接在基于结构药物设计中的应用
分子对接(Molecular docking) 基于结构药物设计(Structure-based drug design) 计算机辅助药物设计(Computer-aided drug design)
2008/3/6
分子对接是研究分子间(如配体和受体)相互作用, 并预测其结合模式和亲合力的一种理论模拟方法。近年来,分子对接方法已成为计算机辅助药物研究领域的一项重要技术, 在数据库搜寻, 组合库设计及蛋白作用研究方面得到了广泛发展。MOLECULAR DOCKING FOR IN STRUCTURE-BASED DRUG DESIGNINGMolecular docking serves as a meth...
keV离子辐照固态腺嘌呤与胞嘧啶的剂量效应研究
离子辐照(Ion implantation) 腺嘌呤(Adenine) 胞嘧啶(Cytosine) 剂量效应(Dose effect)
2008/3/5
研究了经20keV的氮离子、氩离子辐照后,腺嘌呤与胞嘧啶的残存率与注入剂量的关系。结果表明,在相同的剂量下,氮离子对碱基的损伤比氩离子高,而对同种离子而言,胞嘧啶比腺嘌呤表现出较高的辐射敏感性。计算了碱基分子损伤的G值,发现它们随剂量的增大呈减小的趋势。考察了加入自由基清除剂后,碱基损伤剂量效应的变化。并对上述结果提出了初步的解释。DOSE EFFECT OF keV IONS IRRADIATI...
CPM抑制了由1,4NQ诱导的对骨肌肌质网SR钙通道RyR1的激活效应
CPM 1,4NQ 钙通道(Calcium release channel) 硫醇(Thiol) 激活部位(Activation site) SR
2008/3/4
利用7-diethylamino-3-(4'-maleimidylphenyl)-4-methylcoumarin(CPM)甲基化钙通道RyR1上的特异敏感性硫醇的方法,对由1,4-naphthoquinone(1,4NQ)诱导的双相性作用进行了研究,发现CPM能明显阻碍由1,4NQ诱导的对RyR1的激活,但对由1,4NQ产生的抑制没有明显作用。用经CPM预处理过和没有处理过的样品与1,4NQ温育...
BIAcore技术及其在生命科学中的应用
BIAcore技术(BIAcore technique) 生物分子相互作用(biomolecular interaction) 表面等离子共振(surface plasmon resonance (SPR)) 蛋白质组学(proteomics) 信号转导(signal transduction) 新药开发(drug discovery)
2008/3/4
生物分子的活性功能是通过分子之间的相互作用来体现的,了解这种相互作用的过程对于生命科学领域的研究及揭示生命发生发展的基本机制具有重要的意义。基于表面等离子共振(surface plasmon resonance, SPR)的新型生物传感技术———BIAcore(biomolecular interaction analysis)是研究生物分子相互作用的理想工具。它可以实时跟踪检测生物分子间结合、解...