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基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中,PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而,PacBio标准建库方法需要大量DNA输入,限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量,但会引入扩增偏好和人工嵌合序列等错误,影响基因组的完整性以及变异检测的准确性。因此,亟待开发低DNA用量、...
中国科学院南海海洋研究所热带海洋生物资源与生态重点实验室谭烨辉研究团队联合上海海洋大学的科研人员,在海南岛东南海区深水800至1000米采集到一个与幽灵蛸相近的标本,通过形态学和基因的比较分析等,明确其与幽灵蛸存在明显差异,确定其是幽灵蛸目新种——拟幽灵蛸(Vampyroteuthis pseudoinfernalis Qiu, Liu & Huang, sp. nov.)...
开花植物中,花粉的形成以及随后的花粉管生长和受精在植物的育性中具有关键作用。花粉的适当发育和成熟对种子植物的遗传多样性具有重要影响,对农业作物生产产生重要作用。植物中孤儿基因的出现可能是植物不断适应环境的进化结果,其功能可能促进植物的生存。2024年来,拟南芥特异性孤儿基因Qua Quine Starch(QQS)在植物发育和环境适应中的作用备受关注。然而,QQS调控花粉发育的分子机制以及转录激活...
CRISPR-Cas系统是自然界中强大的基因编辑工具,广泛分布在细菌和古生菌中,可以有效抵御外源DNA入侵。作为反击,病毒进化出anti-CRISPR蛋白(Acr),抑制CRISPR-Cas系统的活性。目前,科学家已发现近百种Acr蛋白。这些蛋白通过多样化的机制发挥功能。
截至目前,在线人类孟德尔遗传(OMIM) 数据库已收录 8000 多种单基因遗传病。尽管单基因遗传病被认为是罕见的,其发病率为万分之一,甚至可能低至百万分之一,但单基因病总体发病率高达人口的1%,严重影响人类健康。
西南大学资源昆虫高效养殖与利用全国重点实验室教授代方银团队首次获得了家蚕W染色体完整基因组序列,并揭示鳞翅目昆虫W染色体起源与进化的新机制。日前,相关研究成果在线发表于《科学进展》。
2024年6月18日,Nature Structural & Molecular Biology(NSMB)在线发表了中国科学院上海免疫与感染研究所王岚峰研究组、复旦大学陈振国课题组和美国纪念斯隆-凯特琳癌症中心赵晓岚课题组的合作研究论文:Cryo-EM structures of Smc5/6 in multiple states reveal its assembly and function...
大肠杆菌在生物基化学品及酶蛋白生产中具有广泛的应用。乳糖操纵子系统是大肠杆菌中调控基因表达的重要组成部分,其中阻遏蛋白LacI通过结合操纵序列来抑制基因的转录。诱导剂IPTG通过与LacI结合,解除其抑制作用,从而调控基因表达。然而,IPTG对菌体生长有一定的抑制作用,且价格较昂贵,诱导不可逆(只能开不能关,不能震荡诱导)。
自1948年Barbara McClintock首次报道转座子以来1,这类跳跃遗传元件对宿主演化的重要意义逐渐被揭示2-5。其中,DNA转座子作为主要类型之一,长期以来备受关注。然而,由于以往多为个案研究,DNA转座子活性的决定因素与进化模式的一般规律尚不清晰。不仅如此,尽管DNA转座子可作为基因工程工具用于插入诱变或转基因载体6,7,但目前只有Sleeping Beauty(SB)等少数几种转座...
2024年6月5日,珠江水产研究所观赏渔业研究室在国际学术期刊《Database》(JCR 1区,IF2022=5.8)在线发表“CoSFISH: a comprehensive reference database of COI and 18S rRNA barcodes for fish”的研究论文。该研究得到了中国-东盟海洋合作基金(CAMC-2018F)、2022年省级乡村振兴战略专项种业...
最早的陆地植物出现于距今4亿7千万年前,此后苔藓植物和维管植物各自独立演化。至今,地球上有约2万种苔藓类植物,是仅次于被子植物的第二大类群,分属于苔纲、藓纲和角苔纲三个纲。地钱作为苔纲的代表植物,具有雌雄异株、单倍体主导生活史、基因组简单、冗余性低等特点,适合作为模式植物来进行研究。在进入生殖生长阶段后,精子在精子囊中发育成熟。不同于被子植物的管粉受精模式,即精细胞需要依赖花粉管的定向生长被递送至...
2024年5月31日,中国科学院海洋研究所在海洋腐蚀微生物基因组的高灵敏检测分析技术研发方面取得新进展,成功研发了基于摩擦纳米产电效应的硫酸盐还原菌基因片段的定量检测及智能预警技术,相关成果发表于国际学术期刊Energy & Environmental Science(IF=32.5)。
中国科学院植物研究所宋献军研究组在此前的研究中,克隆了一个编码组蛋白乙酰化酶的基因GRAIN WEIGHT 6a (GW6a),可正向调控水稻籽粒大小(粒长)和单株产量。然而,尚不清楚对于GW6a依赖的籽粒大小调控的基因网络。
近日,西北农林科技大学植物保护学院作物病原真菌功能基因组学研究团队刘慧泉教授课题组揭示了真菌中A-to-I mRNA编辑的酶复合体,并明确了其起源、进化和调控机制,为真菌病害防控和基因编辑工具开发提供了重要的新思路,相关研究成果发表在《自然-通讯》上。
肠道微生物对膳食纤维的代谢,在宿主的生理和健康状况中扮演着重要角色。海带、羊栖菜等海藻,不仅是人类日常饮食的一部分,而且在2000多年前就被用于治疗慢性支气管炎、急性食管炎和瘘管病等。褐藻胶(alginate)是褐藻细胞壁的主要成分,是由甘露糖醛酸 (β-D-mannuronate, M) 和古罗糖醛酸 (α-L-guluronate, G) 两种单体通过β-1,4糖苷键连接成的线性多糖。褐藻胶可...

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