搜索结果: 1-5 共查到“作物学 EST-SSRs”相关记录5条 . 查询时间(0.511 秒)
利用蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)EST数据库开发新的ESTSSRs标记，分析ESTSSRs的分布特征。利用SSRIT软件对NCBI上公布的285 285条蒺藜苜蓿EST序列进行SSR序列的检测，共检测出6 688个SSR序列，分布于6 512个EST中，占整个EST数据库的2.28%。其中二核苷酸重复基元出现的频率最高，占总ESTSSRs的34.4%(2 301条)，其...
根据GenBank中公布的247条草棉EST序列，搜索SSR并进行引物设计。其中的25条序列含有27个SSR，1~6碱基重复类型都存在，二碱基和三碱基重复的频率较高。为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性，依据25条序列共设计25对EST-SSR引物，其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带，产生92个多态性片段，平均每对引物产生3.64个多态性片段。引物的多态性信息含量(PIC)在0.49~0...
花生栽培种EST-SSRs分布特征及应用研究
花生栽培种 EST SSR 开发
2009/11/3
利用自行开发的20 160条花生栽培种荚果EST, 通过序列拼接, 获得8 289条无冗余EST。经搜索, 共检测出740个SSR位点, 分布于651条EST中, 发生频率为7.8%, 平均每6.8 kb EST序列含一个SSR位点。功能注释结果表明具生物过程、分子功能和细胞组分的EST分别为73、111和56条。在花生荚果EST-SSR中, 三核苷酸重复类型出现频率最高, 占总SSR的62.8%...
香蕉SSR分子标记开发和应用有限,通过对棉花SSR分子标记在香蕉中的通用性研究.用1343对棉花EST-SSR引物对贡蕉(AA)和野蕉(BB)两个材料进行转移扩增,得到226对有效扩增的引物.进一步用该226对引物对20个香蕉品种和4个野蕉材料扩增,得到了157对多态性引物.157对多态性引物共扩增到1188个条带,平均7.6个;引物的多态信息含量范围在0.58～0.91之间.依据获得的SSR数据...