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一组新的小麦EST-SSR标记开发及其在遗传图谱构建中的应用
小麦 EST-SSR标记 遗传图谱 RIL
2021/4/7
为了丰富小麦功能分子标记的数量，为小麦功能基因的定位、比较基因组学、小麦起源和进化等方面的研究奠定基础。从前期利用小麦转录组数据鉴定出的8 389个EST-SSR序列中，随机选取585对引物得分大于95的标记进行分析，以川麦42和川农16杂交后自交获得的重组自交系群体为试验材料，利用新开发出的EST-SSR标记，并结合SSR标记和SRAP标记，构建了一张遗传图谱。结果表明，585对EST-SSR引...
厚朴转录组特征分析及EST-SSR标记的开发
厚朴 转录组 Illumina-Solexa测序技术 EST-SSR
2020/3/10
为探明厚朴的基因组信息,开发合适的生物学工具以促进厚朴的遗传育种,本研究利用Illumina-Solexa测序技术对厚朴根、茎皮、叶不同组织的9个样本进行转录组分析,获得大量的序列信息,并以转录组序列为基础进行厚朴SSR分子标记的大规模发掘。结果表明,共获得了109 526条厚朴转录组序列,平均序列长度为1 023 bp,通过与蛋白数据库NR、Swiss-Prot、GO、KOG和KEGG五个数据库...
基于荧光检测技术的多花黑麦草EST-SSR指纹图谱的构建
多花黑麦草 EST-SSR分子标记 指纹图谱 荧光检测 毛细管电泳
2017/11/24
构建基于EST-SSR荧光标记的多花黑麦草（Lolium multiflorum Lam.）DNA指纹鉴定体系，为多花黑麦草品种鉴定提供高通量技术手段，为不同品种的合理应用提供参考依据，有效保护农民利益和育种权益。【方法】利用表型性状差异大的3个品种（特高Tetragold、长江2号ChangjiangNo.2和阿伯德Aubade），通过聚丙烯酰胺凝胶电泳从200对EST-SSR引物中筛选出扩增条...
菊花EST-SSR标记开发及其对万寿菊的可转移性研究
菊花 EST-SSR 万寿菊 可转移性
2017/12/4
为开发菊花EST-SSR标记并用于万春菊资源分析,研究了菊花的EST-SSR特征、标记开发及其在万寿菊上的可转移性。结果表明,菊花EST-SSR出现频率为5.35%,平均每10.64 kb存在1个SSR位点。在这些SSR位点中,共有83种重复基元,2-6核苷酸重复类型分别为10、40、14、5和14种。以14个菊花品种DNA为模板,22对菊花EST-SSR引物中14对可以扩增到清晰且稳定的PCR产...
An EST-SSR marker, bu099658, and its potential use in breeding for yellow rust resistance in wheat
Bulk Segregant Analysis (BSA) Marker-Assisted Selection (MAS) Puccinia striiformis f.sp. tritici Triticum aestivum L. Yr1
2014/3/31
EST-SSR markers, derived from the A and B genomes of wheat were used to identify molecular markers associated with yellow rust resistance. For this purpose, bulk segregant analysis was performed using...
利用EST－SSR标记分析西南扁穗牛鞭草种质的遗传多样性
扁穗牛鞭草 EST－SSR 遗传多样性
2012/3/22
利用禾谷作物EST－SSR标记对采自我国西南地区的40份野生扁穗牛鞭草和3份扁穗牛鞭草国审品种的遗传变异和亲缘关系进行了研究。试验筛选出23对引物对43份供试材料进行扩增，共获得323条带，其中多态性条带261条，多态性条带比率（PPB）达80.4％，多态信息含量（PIC）为0.354～0.500，平均值为0.474，遗传相似系数（GS）为0.690～0.913，表现出丰富的遗传多样性。聚类分析结...
基于EST-SSR的木薯分子标记遗传连锁图谱的构建
EST-SSR 木薯分子 标记遗传 连锁图谱
2011/10/19
此实验以木薯推广品种‘KU50’为母本，‘SC124’为父本通过杂交得到包含240个单株的F1分离群体，利用300对EST-SSR引物，20对SSR和20对SRAP引物组合对亲本和部分群体株系进行多态性分子标记筛选，共获得具有多态性的引物110对。在此基础上，利用这110对多态性引物对该F1群体进行分子标记的多态性分析，共获得269个多态性标记。利用JoinMap 3.0软件对这269个多态性标记...
木薯基因组SSR和EST-SSR在麻疯树和橡胶树中的通用性分析
麻疯树 橡胶树 通用性 EST-SSR
2011/6/7
利用木薯的419对EST-SSR引物和182对基因组SSR引物在5个麻疯树品系和2个橡胶树品系中进行通用性分析。结果显示，木薯EST-SSR在麻疯树和橡胶树中的通用性比例分别为55.85%和38.90%，而木薯基因组SSR在麻疯树和橡胶树中的通用性比例分别为37.36%和26.37%。由此推测，EST-SSR的通用性高于基因组SSR。此外，木薯EST-SSR和基因组SSR的通用性在麻疯树中高于在橡...
利用蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)EST数据库开发新的ESTSSRs标记，分析ESTSSRs的分布特征。利用SSRIT软件对NCBI上公布的285 285条蒺藜苜蓿EST序列进行SSR序列的检测，共检测出6 688个SSR序列，分布于6 512个EST中，占整个EST数据库的2.28%。其中二核苷酸重复基元出现的频率最高，占总ESTSSRs的34.4%(2 301条)，其...
与辣椒抗根结线虫基因Me1紧密连锁的EST-SSR标记开发
辣椒 根结线虫 Me1 基因 EST-SSR
2011/11/25
以含抗根结线虫病基因Me1的PM217与感线虫品种茄门,及其F1、F2作为试验材料,采用南方根结线虫(Meloidogyne spp.)人工接种鉴定,根据鉴定结果,利用分离群体分组分析法(bulked segregant analysis,BSA)建立抗感池,共筛选到3对(118、141及211)多态性EST-SSR引物在抗感池间存在差异。利用Joinmap3.0软件,结合抗病性鉴定,对F2群体进...
为了准确鉴定簇毛麦6VS易位染色体小片段的长度和断点位置，根据定位于小麦第6部分同源群染色体短臂不同区段的EST序列，利用PRIMER5.0软件设计PCR引物，成功开发出3个对6V染色体短臂特异的分子标记（CINAU89740、CINAU90730、CINAU91390）。利用小麦和簇毛麦第六部分同源群染色体短臂的12个缺失系对簇毛麦6VS的8个特异性分子标记进行了定位。标记CINAU88...
为研究ESTSSR 标记在应用于冬小麦品种DUS测试中的可行性，本研究利用21对小麦ESTSSR引物对45份黄淮海地区新育成冬小麦品种的遗传多样性进行了分析。在23份新育成品种中，共检测到61个位点，每个位点的等位基因数量为2~8个，平均2.90个；基因遗传多样性指数为0.08~0.79，平均为0.38。23份新育成品种的遗传距离为0.12~0.69, 平均为0.40。在23份亲本品种中，共检...
【目的】利用小麦EST序列数据库开发EST-SSR标记。【方法】对GenBank/dbEST注册的普通小麦EST序列（2006.4.18—2007.2.4）进行SSR查找,采用Primer5.0软件设计EST-SSR引物,选用3个小麦品种进行有效性检测,利用RIL群体和Mapmaker/Exp3.0软件进行遗传作图。【结果】在265 362条普通小麦EST序列中,共发现6 314个SSR,占整个E...