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2024年9月5日，中国科学院遗传与发育生物学研究所分子系统生物学研究中心举办了第二十五期“未来科学沙龙”。30余位师生参加了本次沙龙,沙龙由钱文峰研究员主持。
DNA右手双螺旋结构的提出开启了分子生物学新篇章1。事实上，除右手双螺旋结构外，还存在其他非经典DNA构象，如三链体DNA（triplex DNA）。三链体DNA是由单链DNA通过胡斯坦氢键（Hoogsteen hydrogen bonds）与双链DNA的大沟特异性结合形成的一种三链结构2。该结构在基因组中广泛分布，发挥重要的基因调控作用，并可导致基因组不稳定性。基于以上功能，三链体形成寡核苷酸（...
中国科学院上海微系统与信息技术研究所在蚕丝神经接口研究方面取得进展（图）
蚕丝蛋白 临床 生物
2024/8/20
2024年7月26日，中国科学院上海微系统与信息技术研究所陶虎研究员团队在高适应性蚕丝蛋白神经接口研究方面取得进展。团队与上海交通大学医学院附属第六人民医院合作，基于蚕丝蛋白材料开发了一种具有高度组织/器官适配性的植入式生物电子器件。在保留丝蛋白材料良好生物相容性的基础上，利用蚕丝蛋白材料的超收缩特性与键合工艺实现了器件的水触发可控几何重构，进一步实现了器件与目标组织或器官在几何结构与功能上的匹配...
天津工业生物所揭示细胞氨基酸组成存在系统水平约束（图）
细胞氨基酸 系统 蛋白质
2024/5/14
在生物学研究中，细胞内的氨基酸组成（AACell）对于生物体的功能和适应性至关重要。尽管单个蛋白质的氨基酸组成（AAP）和蛋白质表达水平在不同条件下会有显著变化，但细胞内总蛋白质的氨基酸组成（AACell）的稳定性却鲜为人知。这一领域的研究对于理解生物体如何在环境变化中调整其代谢和蛋白质表达具有重要意义。
中国科学院新疆理化技术研究所专利： 基于模糊聚类和基因本体语义相似性的可重叠蛋白质复合物识别方法和系统
中国科学院新疆理化技术研究所 专利 模糊聚类 基因本体 语义相似性 蛋白质复合物 识别方法
2023/12/21
本发明提出了一种基于模糊聚类和基因本体语义相似性的可重叠蛋白质复合物识别方法和系统，包括网络构建模块、数据预处理模块、参数定义模块、模型构建模块、模型求解模块、蛋白质复合物识别模块以及结果展示模块，通过综合考量蛋白质相互作用网络中蛋白质间的相互作用关系和蛋白质间的基因本体语义相似性来实现蛋白质复合物识别。本发明直接作用于蛋白质相互作用网络，能够识别网络中的可重叠蛋白质复合物，效果准确度高，能够有效...
本发明公开了一种基于混合隶属度随机块模型的蛋白质相互作用预测方法和系统，该系统由数据处理模块、复合物隶属度计算模块和结果生成模块组成，基于随机块的蛋白质相互作用预测方法，从数据库中获取蛋白质相互作用数据，对获得的数据进行处理；应用随机变分推理对蛋白质相互作用网络进行分析，计算复合物隶属度指标；基于复合物隶属度指标的计算结果，对蛋白质相互作用进行预测，展示预测结果。该系统通过混合隶属度随机块模型以及...
中国科学院研究揭示ABIN1蛋白通过I-型干扰素信号调控造血系统发育疾病新机制（图）
蛋白 系统发育 骨髓增生
2023/12/5
2023年11月27日，中国科学院上海营养与健康研究所章海兵研究组等在《科学进展》（Advanced Science）上，在线发表了题为ABIN1 (Q478) is required to prevent hematopoietic deficiencies through regulating type I IFNs expression的研究论文。研究发现，泛素结合蛋白ABIN1通过泛素结合...
中国科学院新疆理化技术研究所专利：基于模糊聚类和基因本体语义相似性的可重叠蛋白质复合物识别方法和系统
中国科学院新疆理化技术研究所 专利 模糊聚类 基因本体 语义相似性 蛋白质复合物识别
2023/11/30
本发明提出了一种基于模糊聚类和基因本体语义相似性的可重叠蛋白质复合物识别方法和系统，包括网络构建模块、数据预处理模块、参数定义模块、模型构建模块、模型求解模块、蛋白质复合物识别模块以及结果展示模块，通过综合考量蛋白质相互作用网络中蛋白质间的相互作用关系和蛋白质间的基因本体语义相似性来实现蛋白质复合物识别。本发明直接作用于蛋白质相互作用网络，能够识别网络中的可重叠蛋白质复合物，效果准确度高，能够有效...
RNA介导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到重要作用。Argonaute（Ago）蛋白是存在于古菌、细菌和真核生物中的一种蛋白。它为非编码小RNA提供锚位点，达到降解靶基因或者抑制翻译的目的。对比真核生物的Ago，原核生物的Ago展现出多样性，分为三个家族——长A型、长B型和短Ago亚型。原核长A和长B型Ago包括四个结构域，即N端结构域、PAZ结构域、MID结构域和PIWI结构域...
中国科学院生物物理研究所专利：一种非整合的、长时间的、可删除表达载体的表达系统
中国科学院生物物理研究所专利：丙烯酰赖氨酸翻译系统及其应用
中国科学院生物物理研究所专利：3-咪唑基酪氨酸翻译系统及其应用
中国科学院生物物理研究所专利：3-氯代酪氨酸翻译系统及其应用
中国科学院生物物理研究所专利：3-吡唑基酪氨酸翻译系统及其应用
中国科学院生物物理研究所专利：Nε-(1-甲基环丙-2-烯酰胺)-赖氨酸翻译系统及其应用