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Genetic Variability in Hydrastis Canadensis L. Using RAPD Analysis
genetic variation medicinal plant species goldenseal RAPDs AMOVA UPGMA
2014/11/17
ABSTRACT GENETIC VARIABILITY IN HYDRASTIS CANADENSIS L. USING RAPD ANALYSIS FEBRUARY 2009 KERRY J. KELLEY, B.A. MOUNT HOLYOKE COLLEGE M.A. UNIVERSITY OF MASSACHUSETTS AMHERST Directed by: Professor Ly...
广东沿海3个斜带石斑鱼养殖群体的RAPD和线粒体Cyt b基因序列变异分析
斜带石斑鱼 RAPD 线粒体Cyt 遗传变异
2014/9/30
斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)为中国南方重要的海水增养殖经济鱼类,但过度捕捞和人工养殖的快速扩张,导致了其自然资源衰退和遗传多样性降低。文章采用随机扩增多态DNA(RAPD)和线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列分析方法,对惠州、深圳和湛江3个斜带石斑鱼养殖群体进行了遗传多样性状况和遗传差异的研究。结果表明:1)相比较于线粒体Cyt b基因序列分析,RAPD技术在研究斜带...
Molecular Characterization of Selected Local and Exotic Cattle Using RAPD Marker
RAPD-PCR Genetic Distance Polymorphism Cattle Bangladesh
2016/5/10
In order to develop specific genetic markers and determine the genetic diversity of Bangladeshi native cattle (Pabna, Red Chittagong) and exotic breeds (Sahiwal), randomly amplified polymorphic DNA (R...
云南省玉米大斑病菌的RAPD分析
玉米大斑病菌 RAPD 遗传多态性 云南省
2012/11/6
应用7条随机引物对采自云南省不同玉米产区的玉米大斑菌81个菌株的DNA进行了RAPD分析.结果表明,这些菌株共产生60条谱带,其中43条为多态性带,占71.7%.利用UPGMA法对DNA扩增图谱进行聚类分析,以遗传距离0.50为阈值,81个菌株可分为5个遗传群体,表明云南省玉米大斑病菌中具有丰富的种内遗传多样性.然而,这种分子标记所划分的群体与菌株来源地及致病类型间没有直接关系.
应用RAPD技术鉴定地霉的实验研究
地霉菌 随机引物聚合酶链反应 酵母菌DNA提取试剂盒 鉴定
2012/8/10
目的 探讨RAPD技术在快速鉴定地霉中应用。方法 用E.Z.N.A.yeastDNAkit提取地霉菌基因组DNA,采用随机引物AP3(5'-TCGTAGCCAA-3')、ATG(5'-ATGGATCGGC-3')、RP2(5'-AAGGATCAGA-3')、OPA-10(5'-GTGATCGCAG-3')对临床上致病性白地霉、林生地霉皮损株和血液株的基因组DNA进行扩增,对各病原菌的DNA指纹的特...
RAPD和SRAP标记技术在苔藓植物亲缘关系研究中的比较分析
苔藓 RAPD 亲缘关系 遗传多样性
2010/2/22
利用RAPD和SRAP标记技术研究11种苔藓植物的亲缘关系,并进行比较分析。结果表明:RAPD扩增的多态性比率达100%,SRAP扩增的多态性比率达96.9%,两种标记结果均显示了很高的多态性比率。利用SPSS11.5软件对RAPD和SRAP扩增结果进行了聚类分析,两者均与形态学分类基本一致,但与形态学结果也有一定的差异,这种差异主要表现在科以上植物种类之间。同时,两种分子标记的聚类结果之间也存在...
目的 探讨我国不同地域红色毛癣菌分离株的遗传多样性。方法 采用随机扩增DNA多态性(RAPD)方法对来源于我国不同地域(江苏南京,山东济南,广东广州)的32株红色毛癣菌临床分离株进行DNA多态性分析。结果 红色毛癣菌种内差异明显,根据遗传相似性分成三大聚类群,与地域差异及取材部位无明显相关性,而与表型具有一定相关性。结论 随机扩增DNA多态性方法可用于红色毛癣菌的DNA分型,其DNA带型具有一定的...
枸杞基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化
枸杞 基因组DNA RAPD 优化
2009/11/10
[目的]研究枸杞基因组DNA的提取及RAPD反应体系的优化。[方法]采用了进一步优化的CTAB法提取枸杞基因组DNA,检测所提取的DNA的浓度范围,并对RAPD反应体系进行了科学、合理的优化。[结果]结果表明,浓度范围在3.5~5.5 μg/μl,完全能够满足RAPDPCR的要求。[结论]该方法具有步骤少、费用低、效率高等特点,比较适用于枸杞基因组DNA的提取。
瓢虫干标本基因组DNA的提取及RAPD分析
瓢虫 干标本 RAPD-PCR DNA 基因组
2009/11/9
实验对保存多年的瓢虫干标本进行了基因组DNA提取和RAPD-PCR扩增。结果显示DNA分子的提取与保佑 代长短无直接关系,RAPD-PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳检测,分子量大小约为1984bp-630bp;不同种标虫的DNA用同一引物,扩增片段呈多态表现,同一种标虫的干标本保存时间虽不同,但扩增产物中均具有相同的DNA片段。
6种瓢虫的RAPD分析及在分类上应用的研究
鞘翅目 瓢虫 随机扩增多态性DNA 脱氧核糖核酸 分子系统学
2009/10/29
利用随机引物分别对6种瓢虫的DNA进行了聚合酶链式反应(RAPD—PCR)的实验。结果显示,用相同引物扩增不同种瓢虫的基因组DNA,扩增产物多态性DNA 片段的数目是不同的;两种不同引物的扩增产物中,各自呈现出种、属的特异性片段,其可用于种、属的鉴别;聚类图显示了种、属之间亲缘关系的远近程度,并与形态学分类结果相一致。实验分析还发现:七星瓢虫不同个体间多态性DNA 特有带较多,遗传较稳定;龟纹瓢虫...
高梁胞质雄性不育及保持系的RAPD 技术优化
细胞质雄性不育 高粱 RAPD 技术优化
2009/10/29
以高粱细胞质雄性不育系和保持系A1Tx623A/B,A2V4A/B为材料,考察了Mg2+,Taq酶,dNTP,引物,模板等的用量、循环参数及不同的PCR仪对随机扩增多态性DNA(RAPD)反应的影响。结果发现:在25 L体系中,MgC12 2.0 mmol/L,Taq酶0.75 U(1U一1 t~mol/min),dNTP 0.15mmol/L,引物16.5 ng,模板30 ng,明胶0.001 ...
浙江省桃花水母遗传多样性的 RAPD 分析
桃花水母 遗传多样性 RADP 浙江省
2012/9/26
应用RAPD 技术对浙江省杭州、宁波、温州和金华4 个地区桃花水母群体的遗传多样性进行了分析, 从80个随机引物中筛选出10个引物对4 个群体28个个体的基因组 DNA进行扩
增, 共检测到 230 个位点, 分子片段在 200~2 000 bp 之间, 其中多态位点 124 个, 占53.91%; 群体间最大的遗传距离为0.650 6, 最小的遗传距离为 0.245 1, 平均...
5个泥蚶群体遗传多样性的RAPD分析
泥蚶 RAPD 遗传多样性 亲缘关系
2009/9/11
采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,对5个泥蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的20个随机引物中共检测到154个扩增片段,长度在300 bp~2300 bp之间,每个个体扩增条带在1~11条不等。利用Popgen 3.2和PHILIP统计软件,获得实验数据,确立了5个群体间的亲缘关系。结果表明:(1)泥蚶的5个地理群体分化不明显,没有形成不同的地理种群;(2)聚类分析显示,韩国群体与浙江群...
群体遗传学研究中的数据处理方法Ⅰ.RAPD数据的AMOVA分析
群体遗传结构 RAPDistance DCFA 进化距离
2009/9/11
近年来,RAPD数据和AMOVA分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而,由于RAPD标记具显性特点,加上目前进行AMOVA分析所依赖的RAPDistance软件不完善,使得对RAPD数据进行AMOVA分析时存在许多不足。本文介绍了AMOVA分析的基本过程,同时引入一个新的程序DCFA用以替代RAPDistance,并详述了将DCFA与WINAMOVA联用,对RAPD数据进行AMOVA分析...