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来源于湖北省枣疯病植原体分离物16S rDNA和rp基因的序列分析
枣疯病 16S rDNA rp基因 进化树分析
2014/3/16
以田间采集的来源于我国湖北省枣树产业主产区随州市随县种植的表现为“枣疯病”症状的枣树分离株为试材, 对其16S rDNA和核糖体蛋白(ribosomal protein, rp)基因采用Nested-PCR进行扩增以及序列分析。结果表明, 湖北JWB-Hubei植原体分离物16S rDNA基因的核苷酸序列与我国山东、河南等地的分离株一致率均为99%以上, 在进化树中位于同一亚组的不同进化分支;虚拟...
采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)用引物，PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1个P. medicaginis(菌株44390)的ITS1与ITS2，并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbour-joining methods分析法将上述序列和Genbank中已登录的P. sojae、P. m...
中国马铃薯疮痂病病原菌16S rDNA的遗传多样性分析
马铃薯疮痂病 链霉菌 16S rDNA序列 遗传多样性
2009/4/2
【目的】利用16S rDNA序列对来自中国8个省（区）的34株马铃薯疮痂病菌和15株参比菌株进行系统发育分析。【方法】采用链霉菌通用引物对34株测试菌株的基因组进行16S rDNA序列扩增，测序后在GenBank中进行BLASTn比对，选取同源性较高的菌株构建系统发育树。【结果】34个测试菌株均为链霉菌属，其中Streptomyces scabies 12株、S. galilaeus 8株、...